La tercera pel·lícula, Men in Black, és una continuació de la famosa comèdia nord-americana. Reparteixen els mateixos Tommy Lee Jones i Will Smith. El treball del director va ser reprès per Barry Sonnenfeld, productor executiu de Steven Spielberg. Als cinemes, la pel·lícula va començar el 23 de maig de 2012.
Aquesta vegada el paper de l’heroi negatiu l’agafa Jamain Clement, interpreta a Boris. Es tracta d’un feló que va escapar de la presó lunar. Arda amb odi per l’agent Kay, que el juliol de 1969 va agafar el criminal i el va deixar sense mà. Quan Kay s’assabenta de sobte que Boris corria, expressa un gran lament per no haver-lo matat durant la detenció. Després d'això, l'agent desapareix, i només Jane recorda que existia. La resta de la plantilla de negre creu que Kay va morir en un enfrontament amb algun criminal el 1969.
L’única explicació d’aquest trastorn de la realitat és un canvi en el passat. Jay i l’agent O decideixen que va ser Boris qui estava implicat. La confirmació d’això és un altre esdeveniment d’una escala còsmica: la invasió de la raça de Boris a la Terra. En la realitat anterior, això era impossible, ja que Kay va instal·lar un dispositiu de protecció al planeta anomenat "ArcNet". Ara, en relació amb la mort de l’agent fa unes dècades, la Terra no tenia cap cribratge d’enemics espacials.
Jay descobreix que Boris va ser enviat al passat per Jeffrey Price, un distribuïdor d’electrònica que tenia un canvi de temps il·legal en el seu arsenal. L’agent no té més remei que tornar en el temps per salvar la seva parella. I és immediatament arrestat pel jove Kay. Durant els interrogatoris, Jay li diu tot, i el futur soci ho creu. Junts es troben amb el Griffin arcanenc, que té ArkNet. Ara els tres continuen el seu viatge i parteixen per establir protecció a la lluna. Però en un coet són arrestats pel coronel. Ara es converteix en el guardià del misteri de Jay.
A partir d’aquest moment es produeix un ràpid desenvolupament d’esdeveniments. Els herois es troben amb dos Boris i es produeix una baralla. Un criminal del futur és llançat a una mina de coets i el jove Boris també va al seu darrere. Instal·lada protecció a terra. I ara, sembla que la missió de Jay es va acabar, però apareix un jove miraculós supervivent. El coronel mor, però Boris aconsegueix ser destruït. I a la pel·lícula apareix un personatge nou. Un noi surt del cotxe del coronel i comença a buscar el seu pare. L’agent es reconeix a si mateix. Jay torna a temps i es troba amb Kay a la cafeteria Tot ha tornat.
